Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACFD1Q9UGQ2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACFD1Q9UGQ2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms