Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M4

TTC9C, Tetratricopeptide repeat protein 9C, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9CQ8N5M4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TTC9CQ8N5M4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TTC9CQ8N5M4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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