Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SKOR2Q2VWA4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SKOR2Q2VWA4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 897.4 ms