Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PDK4Q16654 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PDK4Q16654 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDK4Q16654 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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PDK4Q16654 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PDK4Q16654 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PDK4Q16654 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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PDK4Q16654 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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PDK4Q16654 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PDK4Q16654 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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