Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPSQ13938 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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