Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PLOD1Q02809 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PLOD1Q02809 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms