Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PKHD1P08F94 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PKHD1P08F94 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PKHD1P08F94 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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PKHD1P08F94 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PKHD1P08F94 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PKHD1P08F94 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PKHD1P08F94 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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