Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGKV3-15P01624 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms