Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSX5O60225 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSX5O60225 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSX5O60225 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms