Protein–RNA interactions for Protein: V9GY05

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY05 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
V9GY05 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
V9GY05 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
V9GY05 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
V9GY05 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
V9GY05 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
V9GY05 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
V9GY05 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
V9GY05 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
V9GY05 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
V9GY05 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
V9GY05 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
V9GY05 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
V9GY05 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
V9GY05 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
V9GY05 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
V9GY05 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
V9GY05 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
V9GY05 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
V9GY05 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
V9GY05 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
V9GY05 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms