Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEFF2Q9UIK5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms