Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRMT1Q9NXH9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms