Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ROPN1BQ9BZX4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms