Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PI4K2AQ9BTU6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PI4K2AQ9BTU6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms