Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CITED1Q99966 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms