Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HELQQ8TDG4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms