Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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VAMP3Q15836 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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VAMP3Q15836 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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VAMP3Q15836 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VAMP3Q15836 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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VAMP3Q15836 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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VAMP3Q15836 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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VAMP3Q15836 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VAMP3Q15836 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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