Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HMGN3Q15651 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms