Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNEQ04844 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms