Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUCB1Q02818 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms