Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFNA21P01568 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms