Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms