Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VAPAQ9P0L0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
VAPAQ9P0L0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms