Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BIN3Q9NQY0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BIN3Q9NQY0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms