Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMURF2Q9HAU4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMURF2Q9HAU4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMURF2Q9HAU4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMURF2Q9HAU4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMURF2Q9HAU4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMURF2Q9HAU4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMURF2Q9HAU4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMURF2Q9HAU4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMURF2Q9HAU4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMURF2Q9HAU4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms