Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
POLR1EQ9GZS1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms