Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DPCDQ9BVM2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms