Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LIAT1Q6ZQX7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms