Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PITPNAQ00169 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms