Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CHI3L1P36222 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms