Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCKSP29966 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms