Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD34P28906 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD34P28906 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD34P28906 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD34P28906 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD34P28906 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD34P28906 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD34P28906 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD34P28906 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD34P28906 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD34P28906 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD34P28906 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD34P28906 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD34P28906 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms