Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NME1P15531 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NME1P15531 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NME1P15531 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NME1P15531 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NME1P15531 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms