Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RD3LP0DJH9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms