Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NPIPB9F8W1W9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms