Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VAMP8Q9BV40 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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