Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX2Q99697 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms