Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SYDE1Q6ZW31 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms