Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB3L3Q68CJ9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms