Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USPL1Q5W0Q7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USPL1Q5W0Q7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms