Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SIX1Q15475 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SIX1Q15475 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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