Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP1A4Q13733 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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