Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 EXOSC2-204ENST00000372358 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.451e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 PDXDC1-216ENST00000569715 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.456e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CPT1A-206ENST00000540367 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.476e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RAC1-206ENST00000497741 651 ntTSL 211.97□□□□□ -0.496e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 EXOSC2-202ENST00000372351 1885 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.541e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CPT1A-201ENST00000265641 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.66e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 MAP1A-202ENST00000382031 10553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.626e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 EXOSC2-211ENST00000546165 1956 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.661e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 EXOSC2-203ENST00000372352 1957 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.721e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 EXOSC2-207ENST00000467138 2766 ntTSL 1 (best)10.37□□□□□ -0.751e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 EXOSC2-205ENST00000430138 2533 ntTSL 210.04□□□□□ -0.81e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 EXOSC2-209ENST00000491115 739 ntTSL 59.29□□□□□ -0.921e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.946e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 DSCR8-205ENST00000472602 766 ntTSL 37.94□□□□□ -1.146e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CMTM4-205ENST00000581487 7026 nt7.9□□□□□ -1.156e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 SNX12-204ENST00000483560 700 ntTSL 57.85□□□□□ -1.156e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 IWS1-212ENST00000637187 1021 ntTSL 57.31□□□□□ -1.241e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.253e-7■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RTN4-213ENST00000485749 832 ntTSL 25.41□□□□□ -1.543e-7■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.675e-7■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RPL27-203ENST00000587478 584 ntTSL 225.29■■□□□ 1.641e-29■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RPL9-204ENST00000503040 571 ntTSL 45.17□□□□□ -1.582e-9■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.53e-10■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.363e-10■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.143e-10■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.992e-7■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.712e-7■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FKBP8-202ENST00000544835 1292 ntTSL 1 (best)21.89■■□□□ 1.092e-7■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FKBP8-211ENST00000601844 1548 ntTSL 520.3■□□□□ 0.842e-7■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.584e-10■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.484e-10■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.465e-7■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.385e-7■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 SMARCD2-204ENST00000450364 993 ntTSL 516.5■□□□□ 0.235e-7■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.34e-8■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 NPM3-203ENST00000468544 393 ntTSL 511.89□□□□□ -0.514e-8■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.867e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CDK10-209ENST00000505733 1703 ntTSL 219.87■□□□□ 0.777e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CDK10-204ENST00000472018 2532 ntTSL 217.15■□□□□ 0.347e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CDK10-201ENST00000331006 3344 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.437e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 SAMD4B-204ENST00000596271 578 nt14.49□□□□□ -0.091e-9■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.212e-9■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RPS3-211ENST00000528847 639 ntTSL 512.59□□□□□ -0.396e-67■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 PPIL1-202ENST00000483552 1347 ntTSL 28.54□□□□□ -1.044e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.224e-11■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 TSTA3-207ENST00000527677 541 ntTSL 219.6■□□□□ 0.732e-18■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 TSTA3-208ENST00000528920 964 ntTSL 517.36■□□□□ 0.372e-18■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 TSTA3-202ENST00000524719 762 ntTSL 316.78■□□□□ 0.282e-18■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 ARL6IP4-206ENST00000413381 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 515.75■□□□□ 0.112e-7■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 GUK1-227ENST00000485083 871 ntTSL 330.46■■■□□ 2.473e-9■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 GUK1-236ENST00000493209 735 ntTSL 523.65■■□□□ 1.383e-9■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.584e-8■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.484e-8■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.583e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.113e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.033e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 POR-222ENST00000493973 1028 ntTSL 220.91■□□□□ 0.941e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.841e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.461e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 POR-216ENST00000454934 2295 ntTSL 317.79■□□□□ 0.441e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.311e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.565e-7■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FDFT1-203ENST00000446331 1558 ntTSL 226.51■■□□□ 1.835e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.425e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.375e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.265e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.885e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.265e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.255e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.25e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FDFT1-225ENST00000622850 1987 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.375e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FDFT1-212ENST00000528643 1909 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.935e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.165e-20■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.492e-7■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 TPM4-213ENST00000591226 2672 nt12.56□□□□□ -0.42e-7■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 TPM4-207ENST00000588032 712 ntTSL 312.09□□□□□ -0.472e-7■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.12e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.72e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CHMP4A-207ENST00000533523 1266 ntTSL 1 (best)19.31■□□□□ 0.682e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.612e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 AL136295.1-201ENST00000530611 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.242e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 CHMP4A-209ENST00000542700 847 ntTSL 39.9□□□□□ -0.822e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -14e-9■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 PVT1-203ENST00000513868 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.111e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.042e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RABL6-206ENST00000436380 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.44■□□□□ 0.222e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RABL6-209ENST00000466096 3949 ntTSL 1 (best)15.42■□□□□ 0.062e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 RABL6-207ENST00000461992 763 ntTSL 1 (best)15.29■□□□□ 0.042e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 MACROD1-205ENST00000542105 431 ntTSL 216.02■□□□□ 0.162e-6■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 GART-201ENST00000361093 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.966e-9■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 GART-213ENST00000467575 922 ntTSL 38.03□□□□□ -1.126e-9■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 GART-211ENST00000460305 389 ntTSL 1 (best)4.17□□□□□ -1.746e-9■■■□□ 18.3
PABPC4Q13310 METRN-202ENST00000564661 1174 ntTSL 1 (best)24.54■■□□□ 1.522e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.182e-6■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.543e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 PPP6R1-204ENST00000587457 2389 ntTSL 217.07■□□□□ 0.323e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.375e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.115e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.185e-7■■■□□ 18.2
PABPC4Q13310 HECTD1-208ENST00000554882 3748 ntTSL 56□□□□□ -1.455e-7■■■□□ 18.2
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