Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TTPAP49638 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTPAP49638 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTPAP49638 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTPAP49638 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTPAP49638 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTPAP49638 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTPAP49638 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTPAP49638 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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