Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB5P09067 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB5P09067 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms