Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
APOA1P02647 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
APOA1P02647 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms