Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAP4K4O95819 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms