Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ITGA10O75578 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms