Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC44.73■■■■■ 4.75
LAMC3Q9Y6N6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
LAMC3Q9Y6N6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
LAMC3Q9Y6N6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC44.71■■■■■ 4.75
LAMC3Q9Y6N6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
LAMC3Q9Y6N6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC44.69■■■■■ 4.75
LAMC3Q9Y6N6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.75
LAMC3Q9Y6N6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
LAMC3Q9Y6N6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
LAMC3Q9Y6N6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
LAMC3Q9Y6N6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
LAMC3Q9Y6N6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
LAMC3Q9Y6N6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
LAMC3Q9Y6N6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC44.66■■■■■ 4.74
LAMC3Q9Y6N6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
LAMC3Q9Y6N6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
LAMC3Q9Y6N6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
LAMC3Q9Y6N6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
LAMC3Q9Y6N6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
LAMC3Q9Y6N6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
LAMC3Q9Y6N6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
LAMC3Q9Y6N6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
LAMC3Q9Y6N6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
LAMC3Q9Y6N6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
LAMC3Q9Y6N6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.62■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC44.59■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
LAMC3Q9Y6N6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
LAMC3Q9Y6N6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.56■■■■■ 4.72
LAMC3Q9Y6N6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
LAMC3Q9Y6N6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
LAMC3Q9Y6N6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
LAMC3Q9Y6N6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC44.54■■■■■ 4.72
LAMC3Q9Y6N6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC44.54■■■■■ 4.72
LAMC3Q9Y6N6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
LAMC3Q9Y6N6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
LAMC3Q9Y6N6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
LAMC3Q9Y6N6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
LAMC3Q9Y6N6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
LAMC3Q9Y6N6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
LAMC3Q9Y6N6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC44.51■■■■■ 4.72
LAMC3Q9Y6N6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
LAMC3Q9Y6N6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
LAMC3Q9Y6N6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
LAMC3Q9Y6N6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
LAMC3Q9Y6N6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
LAMC3Q9Y6N6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
LAMC3Q9Y6N6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC44.48■■■■■ 4.71
LAMC3Q9Y6N6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
LAMC3Q9Y6N6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
LAMC3Q9Y6N6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
LAMC3Q9Y6N6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
LAMC3Q9Y6N6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
LAMC3Q9Y6N6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
LAMC3Q9Y6N6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.71
LAMC3Q9Y6N6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.71
LAMC3Q9Y6N6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
LAMC3Q9Y6N6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
LAMC3Q9Y6N6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC44.43■■■■■ 4.7
LAMC3Q9Y6N6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC44.43■■■■■ 4.7
LAMC3Q9Y6N6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
LAMC3Q9Y6N6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
LAMC3Q9Y6N6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
LAMC3Q9Y6N6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC44.42■■■■■ 4.7
LAMC3Q9Y6N6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
LAMC3Q9Y6N6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
LAMC3Q9Y6N6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
LAMC3Q9Y6N6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
LAMC3Q9Y6N6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
LAMC3Q9Y6N6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
LAMC3Q9Y6N6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
LAMC3Q9Y6N6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
LAMC3Q9Y6N6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
LAMC3Q9Y6N6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC44.38■■■■■ 4.69
LAMC3Q9Y6N6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
LAMC3Q9Y6N6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
LAMC3Q9Y6N6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
LAMC3Q9Y6N6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC44.35■■■■■ 4.69
LAMC3Q9Y6N6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
LAMC3Q9Y6N6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
LAMC3Q9Y6N6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
LAMC3Q9Y6N6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
LAMC3Q9Y6N6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC44.34■■■■■ 4.69
LAMC3Q9Y6N6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
LAMC3Q9Y6N6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms