Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SF3B6Q9Y3B4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SF3B6Q9Y3B4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SF3B6Q9Y3B4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3B6Q9Y3B4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms